1.申请商标无效的理由是对方的注册商标存在着明显的瑕疵，比如说违反了商标法当中的规定，另外就是有证据证明对方是通过不正当手段获得的商标。
2.法律依据：《中华人民共和国商标法》
第八条 任何能够将自然人、法人或者其他组织的商品与他人的商品区别开的标志，包括文字、图形、字母、数字、三维标志、颜色组合和声音等，以及上述要素的组合，均可以作为商标申请注册。
第九条 申请注册的商标，应当有显著特征，便于识别，并不得与他人在先取得的合法权利相冲突。
商标注册人有权标明“注册商标”或者注册标记。